GMER, bir "rootkit" algılama ve temizleme yazılımıdır. "Rootkit"ler özellikle bilgisayar korsanları tarafından kullanılmakta olan zararlı araçlardır. Bilgisayar korsanları bu zararlı araçlarla izinsiz olarak giriş yaptıkları ve saldırdıkları bilgisayarlarda kendilerini gizlemekte ve bilgisayar yöneticilerinin kullanım haklarına sınırsızca sahip olabilmektedirler. Ayrıca bilgisayar korsanları "rootkit"ler ile kullanmış oldukları diğer zararlı araçları(truva atları, casus yazılımlar, solucanlar) gizli hale getirerek oldukça sessiz biçimde kişisel ve kurumsal bilgisayar sistemlerine zarar verebilmektedirler. Yani "rootkit"ler hem kendileri gizli olarak sistemde çalışırken hem de diğer zararlı araçların gizlenmesini sağlamaktadırlar.

GMER yazılımı "rootkit"ler ile sisteminize verilebilecek olan zararın önüne geçme işlevini gerçekleştirmektedir. Sahip olduğu veritabanı ile popüler tüm "rootkit"leri tanımlayabilen yazılım bu zararlıları sistemden kaldırma işlemini de başarılı biçimde yapabilmektedir. Çalışan uygulamaları, Windows Kayıt Defterini ve tüm sabit sürücülerinizi gizli biçimde çalışan bu zararlıları tanımlamak için çok hızlı bir biçimde taramakta ve bulduğu gizlenmiş araçları sistem üzerinden kaldırabilmektedir. Boyutu oldukça küçük olan yazılımın kullanımı da gayet basittir. Zaten kullanışlı bir arayüze sahip olması ve bir tıklama ile işlem yapmaya başlaması bunu ortaya koymaktadır.